紫外线通过打断微生物脱氧核糖核酸(DNA)的腺嘌呤和硫胺分子，使其无法继续繁殖。微生物因而可在不使用化学药品的情况下被杀死。尽管254纳米是有效消毒波长，但脱氧核糖核酸能最有效地吸收的波长为265纳米的紫外线。了解这些不同波长紫外线杀菌能力差异是设计具有杀菌效果好、效率高的紫外线消毒设备的基础。总体来说，低压系统最好用于小流量、间歇性系统，而中压技术则更适合高流速水体消毒。

　　药品生产一般都是由几个工艺段组成，在不同阶段之间本身也可能遭至微生物污染，而紫外线消毒可以被用作为有效的保障，从而确保药品在各个工艺段之间不会发生变质。

　　紫外线安装典型阶段是在活性碳过滤器之后或RO之前，或者将紫外消毒及TOC降解系统设置于精处理单元。活性碳过滤器后面加上合适紫外消毒系统或RO处理单元之前装一个合适紫外线消毒系统将杀灭进水中99.9%的细菌。

　　安装紫外线系统后，不仅节省了成本，而且紫外线提供了高标准的脱氯效果，而且避免了所有化学物质或颗粒活性炭过滤器的缺点。

　　紫外线(UV)技术最初是用来确保城镇自来水的完全消毒。自40多年前该技术推出以来，现在已经应用于全球范围内许多行业包括制药企业的消毒、TOC(总有机碳的含量)降解、臭氧和氯胺分解以及生产工艺用水的余氯脱除。水是制药过程中用量最大的物质，在更多严格标准的驱动及日益复杂工艺要求下消毒技术已被采用。紫外线杀菌灯 是一种重要的杀菌工具，可以确保纯净水回路在最高微生物污染标准下运行。其好处是多方面的安装容易、占地面积小、维修简便，可由现场工作人员进行。作为一种非化学处理方法，不会对产品的稳定性造成影响，且产品不会有意外的残留物、颜色和气味。